El Programa de Trabajo del Comité para la Mejora de la Regulación gira en torno a la constitución de una serie de grupos de trabajo de carácter técnico, formados por representantes designados por los miembros del Comité que lo deseen. Su objetivo principal es estudiar la aplicación de los principios de buena regulación económica, que puedan ser posteriormente debatidos y analizados en el Pleno y en la Comisión Local para la Mejora de la Regulación.
Hasta el momento se han creado los siguientes grupos de trabajo: